Οι επιδημιολόγοι εργάζονται σε ποικίλα περιβάλλοντα. Η εργασιακή τους βάση μπορεί να βρίσκεται στο συντονιστικό κέντρο της αποστολής ή στο πρόγραμμα. Πιθανώς να υποστηρίζουν περισσότερα από ένα προγράμματα και η δουλειά τους ποικίλει: από έρευνες για τη θνησιμότητα μέχρι χαρτογράφηση της μετάδοσης ασθενειών. Ανάμεσα σε άλλα είναι υπεύθυνοι να διενεργούν έρευνες στην κοινότητα, να ετοιμάζουν αναφορές οι οποίες πρόκειται να χρησιμοποιηθούν για το σχεδιασμό του προγράμματος. Επίσης συμβάλλουν στο σχεδιασμό σωστής ανταπόκρισης σε εξάρσεις επιδημιών. Επιπλέον είναι υπεύθυνοι να αναπτύσσουν τις ικανότητες των ιατρικών ομάδων στην ανάλυση και ερμηνεία των αποτελεσμάτων.